Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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FOXF2Q12947 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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FOXF2Q12947 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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FOXF2Q12947 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXF2Q12947 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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