Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CASQ1P31415 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms