Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HLA-DQB1P01920 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HLA-DQB1P01920 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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