Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SCN2BO60939 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SCN2BO60939 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCN2BO60939 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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