Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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