Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms