Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms