Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms