Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDK1Q15118 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms