Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LynP25911 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LynP25911 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LynP25911 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LynP25911 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LynP25911 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LynP25911 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LynP25911 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LynP25911 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LynP25911 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LynP25911 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LynP25911 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LynP25911 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LynP25911 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LynP25911 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LynP25911 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms