Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NdnP25233 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NdnP25233 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NdnP25233 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NdnP25233 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NdnP25233 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NdnP25233 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NdnP25233 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NdnP25233 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NdnP25233 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NdnP25233 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NdnP25233 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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