Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk11bP24788 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk11bP24788 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms