Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAMP1P23763 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms