Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06336 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06336 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06336 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06336 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06336 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06336 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06336 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms