Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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