Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam71e1A1L3C1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms