Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms