Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC145625.1-201ENST00000441444 592 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HLA-DMAP28067 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms