Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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CDH18Q13634 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CDH18Q13634 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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