Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC96Q2M329 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC96Q2M329 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC96Q2M329 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC96Q2M329 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC96Q2M329 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
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CCDC96Q2M329 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CCDC96Q2M329 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CCDC96Q2M329 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CCDC96Q2M329 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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CCDC96Q2M329 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC96Q2M329 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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