Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IMPG1Q17R60 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms