Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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PDCD1Q15116 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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