Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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