Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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PPARGC1AQ9UBK2 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PPARGC1AQ9UBK2 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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