Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
XCL2Q9UBD3 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms