Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SEMA3CQ99985 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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