Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 FAM13C-214ENST00000611933 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC027045.2-201ENST00000634974 1571 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL390856.1-201ENST00000412174 628 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms