Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
TRIM71Q2Q1W2 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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