Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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