Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FAM187BQ17R55 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms