Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HTR4Q13639 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HTR4Q13639 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms