Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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