Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
ACADSBP45954 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms