Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM1Q9NRU3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM1Q9NRU3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms