Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms