Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ska1Q9CPV1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ska1Q9CPV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms