Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms