Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms