Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan9Q8BJU2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms