Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms