Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms