Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clpsl2Q3UW21 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clpsl2Q3UW21 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms