Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF4Q2M2E3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms