Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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