Protein–RNA interactions for Protein: Q05AC5

4930430A15Rik, RIKEN cDNA 4930430A15, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930430A15RikQ05AC5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
4930430A15RikQ05AC5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930430A15RikQ05AC5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms