Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SgcdP82347 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgcdP82347 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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