Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd13P70217 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms