Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCAMP50895 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCAMP50895 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCAMP50895 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms