Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGAEP38570 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms