Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP1P28562 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms